SNP，全稱 Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因組上單個核苷酸的變異，包括轉換、顛換、缺失和插入，形成的遺傳標記，其數量很多，多態性豐富。一般而言,SNP 是指變異頻率大于 1 % 的單核苷酸變異。SNP是生物體普遍，分布的多態性差異，被生物學家和育種家應用于性狀基因的精細定位、分子輔助育種、種質資源鑒定等。

  目前進行SNP檢測的主要方法有基因分型微陣列，實時熒光定量法基因分型，全基因組測序法，靶向捕獲基因分型，擴增子基因分型等。

  NuGEN也推出了一個新的基因分型方法，Allegro基因分型。

  Allegro基因分型特點：

    酶打斷，操作更便利，易于自動化操作;

    Dimer free技術，無接頭二聚體污染;

    擁有高達3072個barcodes，能更大程度節約SNPs檢測成本;

    SPET專利性技術，SNP兩端100bp以內設計探針，適用于設計任何已知基因組探針，單向forward read只需測到100bp以上就可以有效捕獲目標SNP位點，可檢測高達數十萬個SNP位點。

    優化的探針位置，可更大程度提高SNP檢出效率;

    目前利用Allgero設計探針的物種數量已超過60個。

   Allegro可以獲得高的on Target率及探針呈現率;

   24h完成實驗操作，可與多種自動化平臺配套使用。

  參考文獻：

  Davide Scaglione1, Sara Pinosio, Fabio Marroni, et al.2019 Single primer enrichment technology as a tool for massive genotyping: a benchmark on black poplar and maize. Annals of Botany 124:543–551

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